sábado, 19 de enero de 2013

Curso gratuito de R en Coursera

Descubrimos en el blog perosnal de José María Mateos llamado Las penas del Agente Smith, una entrada sobre un curso gratuito de Análisis de Datos con R.


Comienza el 22 de enero y durará 8 semanas y como os comento se basa en el software R de código abierto y gratuito orientado al análisis estadístico. El curso se realiza a través de la plataforma web Coursera, es gratuito e impartido por el profesor Jeff Leek, profesos de bioestadística en Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health.

viernes, 18 de enero de 2013

Prueba Estadística “t” de Student

Continuando con la serie de entradas sobre los diferentes test estadísticos (ver las ya publicadas en en el Blog: Spearman, Wilcoxon y Shapiro-Wilks, prueba de F, Chi Cuadrado, Fisher, McNemar, Binomial, Correlación De Pearson), nos llega el turno de estudiar la prueba t de Student.

¿Qué hay que saber de la "t" de Student? 

Se utiliza para determinar si hay una diferencia significativa entre las medias de dos grupos, es decir que se utiliza cuando deseamos comparar dos medias.
Se utiliza para la comparación de dos medias de poblaciones independientes y normales.
Asumimos que las variables dependientes tienen una distribución normal. 

Especificamos el nivel de la probabilidad (nivel de la alfa, nivel de la significación, p) que estamos dispuestos a aceptar  (p < .05 es un valor común que se utiliza).
  • Con una prueba t, tenemos una variable independiente y una dependiente.
  • La variable independiente (por ejemplo sexo) solo puede tener dos niveles (hombre y mujer).
  • Si la independiente tuviera más de dos niveles, después utilizaríamos un análisis de la variación unidireccional (ANOVA).
  • La prueba estadística para t de Student es el valor t. Conceptualmente, la t-valor representa el número de unidades estándares que están separando las medias de los dos grupos.
  • Si nuestra t-prueba produce una t-valor que da lugar a una probabilidad de .01, decimos que la probabilidad de conseguir la diferencia que encontramos sería por casualidad de 1 de cada 100 veces.

Cuatro factores contribuyen para indicar si la diferencia entre dos medias de los grupos se puede considerar significativa:
  • Cuanto mayor es la diferencia entre las dos medias, mayor es la probabilidad que una diferencia estadística significativa existe.
  • El tamaño de la muestra es extremadamente importante en la determinación de la significación de la diferencia entre las medias. Aumentando el tamaño de la muestra, las medias tienden a ser más estables y más representativas.
  • Un nivel más grande de la alfa requiere menos diferencia entre las medias (p <0 font="font">.05). 
  •  Se debe utilizar una hipótesis (con dos colas) no directivas.

Asunciones subyacentes la prueba de t:
  • Las muestras se han dibujado aleatoriamente a partir de sus poblaciones respectivas.
  • La población se debe distribuir normalmente.
  • Unimodal (un modo).
  • Simétrico (las mitades izquierdas y derechas son imágenes espejo), el mismo número de gente arriba o abajo de la media.
  • Acampanado (altura máxima (moda) en el medio).
  • Media, moda, y mediana se localizan en el centro.
  • Asintótico (cuanto más lejos se aleja la curva de la media, más cercana será el eje de X; pero la curva nunca debe tocar el eje de X).
  • El número de personas en las poblaciones debe tener la misma varianza (s2 = s2).Si no es el caso se utiliza otro cálculo para el error estándar.

Existen 2 tipos de prueba t de Student

  • Test t para diferencia par ( grupos dependientes, test t correlacionado) : df= n (número de pares) -1

Esto se refiere a la diferencia entre las cuentas medias de una sola muestra de individuos que se determina antes del tratamiento y después del tratamiento. Puede también comparar las cuentas medias de muestras de individuos que se aparean de cierta manera (por ejemplo los hermanos, madres, hijas, las personas que se emparejan en términos de las características particulares).
  • Test t para muestras independientes
Esto se refiere a la diferencia entre los promedios de dos poblaciones.

Básicamente, el procedimiento compara los promedios de dos muestras que fueron seleccionadas independientemente una de la otra.

Un ejemplo sería comparar cuentas matemáticas de un grupo experimental con un grupo de control.
¿Cómo decido qué tipo de t-prueba a utilizar?

Error tipo I:
  • Rechaza una hipótesis nula que sea realmente verdad. La probabilidad de hacer un error tipo I depende del nivel alfa que se seleccionó.
  • Si se fijó la probabilidad alfa en p < 05, entonces existe un 5% de posibilidades de hacer un error de tipo I.
  • Se puede reducir la posibilidad de hacer un error tipo I fijando un nivel alfa más pequeño (p < .01). El problema haciendo esto es que se aumenta la posibilidad de un error tipo II.
Error tipo II:
  • Falla en rechazar una hipótesis nula que sea falsa.
  • La idea básica para calcular una prueba de Student es encontrar la diferencia entre las medias de los dos grupos y dividirla por el error estándar (de la diferencia), es decir la desviación de estándar de la distribución de las diferencias.
  • Un intervalo de confianza para una prueba t con dos colas es calculado multiplicando los valores críticos por el error de estándar y agregando y restando eso de la diferencia de las dos medias.
  • El efecto tamaño se utiliza para calcular la diferencia práctica. Si existen varios miles de pacientes, es muy fácil encontrar una diferencia estadísticamente significativa
Saber si esa diferencia es práctica o significativa es otra pregunta. 
  • Con los estudios implicando diferencias de grupo, el tamaño del efecto es la diferencia de las dos medias dividido por la desviación estándar del grupo control (o la desviación estándar media de ambos grupos si no hay grupo de control).
  • Generalmente, el tamaño del efecto es solamente importante si existe una significación estadística.
  • Un efecto tamaño de 2 se considera pequeño, 5 se considera medio, y 8 se considera grande.
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jueves, 10 de enero de 2013

Libros interesantes de Estadística

Uno de los objetivos de Blog de Estadística, es proporcionar información a nuestros visitantes sobre técnicas estadísticas y de análisis de datos. Para lograrlo, todas las semanas vamos  a promocionar una serie de libros relacionados con la estadística que podréis comprar gracias a Amazon en papel o en formato digital.
  • Estadística para ingenieros y científicos de William Navidi: 900 páginas. Editor: McGraw-Hill Interamericana de España S.L.; Edición: 1 (10 de abril de 2006). Idioma: Español. ISBN-10: 9701056299. ISBN-13: 978-970105629.
  • Estadística de María Álvarez: En este libro, estructurado en 12 capítulos, la autora presenta, con el rigor matemático imprescindible, los principios fundamentales de la Estadística. Se incluyen además numerosos ejemplos relacionados con aspectos demográficos y económicos actuales, lo que facilita la comprensión sobre la correcta utilización de la Estadística en la investigación aplicada.433 páginas.
  • Cómo mentir con Estadísticas de Darrell Huff. Versión Kindle. Lo que estas páginas, escritas con ingenio y humor, nos ofrecen es, en realidad, un curso de sentido común para aprender a descubrir los ardides con los que cada día pretenden engañarnos, manipulando cifras y gráficas, los medios de comunicación, los políticos, la publicidad. Lo que aquí se nos cuenta resulta divertido; pero es bueno tomarlo en serio, porque, como nos dice el autor: "los desaprensivos ya conocen estos trucos; los hombres honrados deben aprenderlos en defensa propia".
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miércoles, 9 de enero de 2013

Test Estadísticos: Spearman, Wilcoxon y Shapiro-Wilks

Hace unos días escribimos un post sobre algunos de los principales test estadísticos (Prueba de F, Chi Cuadrado, Fisher, McNemar, Binomial, Correlación de Pearson). En el post actual hablaremos brevemente del test de correlación de Spearman, Wilcoxon y Shapiro Willks.

TEST DE CORRELACIÓN DE SPEARMAN
Es una medición no paramétrica de correlación, asume una función monotónica arbitraria para describir la relación entre dos variables, sin hacer ningunas asunciones sobre la distribución de frecuencia de las variables.
A la diferencia del coeficiente del test de Pearson, no requiere la asunción que la relación entre las variables es linear, ni que las variables sean medidas en escalas del intervalo; puede ser utilizado para variables medidas en nivel ordinal.
Se utiliza si no se cumplen las condiciones de aplicación del test de Pearson.
Es una variante del test de correlación de Pearson se aplica cuando cada valor en sí no es tan importante como su situación respecto a los restantes.
Sus valores se interpretan exactamente igual que los del coeficiente de correlación de Pearson.
La correlación de Spearman mide el grado de asociación entre dos variables cuantitativas que siguen una tendencia siempre creciente o siempre decreciente.
Es más general que el Coeficiente de correlación de Pearson, la correlación de Spearman, en cambio se puede calcular para relaciones exponenciales o logarítmicas entre las variables.

TEST DE WILCOXON
Contrasta la hipótesis nula de que la muestra procede de una población en la que la magnitud de las diferencias positivas y negativas entre los valores de las variables es la misma.
Prueba estadística no paramétrica para la comparación de dos muestras (dos tratamientos).
Las distribuciones de datos no necesitan seguir la distribución normal.
Es por tanto una prueba menos restrictiva que la prueba t-Student.

PRUEBA DE SHAPIRO-WILKS.
Aunque esta prueba es menos conocida es la que se recomienda para contrastar el ajuste de nuestros datos a una distribución normal, sobre todo cuando la muestra es pequeña (n<30 font="font">
Mide el ajuste de la muestra a una recta, al dibujarla en papel probabilístico normal.

viernes, 7 de diciembre de 2012

2013 Año Internacional de la Estadística

El Año Internacional de la Estadística (Estadística 2013) es una celebración y un reconocimiento a nivel mundial de las aportaciones de la ciencia estadística. A través del esfuerzo conjunto de organizaciones de todo el mundo se pretende promover la importancia de la estadística entre la comunidad científica, los usuarios de datos públicos y privados, los medios de comunicación, políticos, empresarios, estudiantes y el público en general.


Los objetivos que se persiguen son:
  • Aumentar la conciencia pública sobre el poder y el impacto de la estadística en todos los aspectos de nuestra sociedad.
  • Promover la estadística como una profesión, especialmente entre la gente joven.
  • Fomentar la creatividad y el desarrollo de las ciencias de la probabilidad y la estadística.

Podéis ver las actividades haciendo click aquí.

Web Oficial: http://www.statistics2013.org/